Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NGFRP08138 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NGFRP08138 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NGFRP08138 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NGFRP08138 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NGFRP08138 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NGFRP08138 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NGFRP08138 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NGFRP08138 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NGFRP08138 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NGFRP08138 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NGFRP08138 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NGFRP08138 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NGFRP08138 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NGFRP08138 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NGFRP08138 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NGFRP08138 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NGFRP08138 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NGFRP08138 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NGFRP08138 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NGFRP08138 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NGFRP08138 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NGFRP08138 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NGFRP08138 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NGFRP08138 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NGFRP08138 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NGFRP08138 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NGFRP08138 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NGFRP08138 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NGFRP08138 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NGFRP08138 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NGFRP08138 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NGFRP08138 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NGFRP08138 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NGFRP08138 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NGFRP08138 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NGFRP08138 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NGFRP08138 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NGFRP08138 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NGFRP08138 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NGFRP08138 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NGFRP08138 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NGFRP08138 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NGFRP08138 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NGFRP08138 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NGFRP08138 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NGFRP08138 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NGFRP08138 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NGFRP08138 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NGFRP08138 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NGFRP08138 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NGFRP08138 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NGFRP08138 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NGFRP08138 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NGFRP08138 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NGFRP08138 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NGFRP08138 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NGFRP08138 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NGFRP08138 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NGFRP08138 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NGFRP08138 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NGFRP08138 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NGFRP08138 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NGFRP08138 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NGFRP08138 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NGFRP08138 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NGFRP08138 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NGFRP08138 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NGFRP08138 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NGFRP08138 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NGFRP08138 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NGFRP08138 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NGFRP08138 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NGFRP08138 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NGFRP08138 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NGFRP08138 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NGFRP08138 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NGFRP08138 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NGFRP08138 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NGFRP08138 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NGFRP08138 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NGFRP08138 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NGFRP08138 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NGFRP08138 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NGFRP08138 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NGFRP08138 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NGFRP08138 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NGFRP08138 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NGFRP08138 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NGFRP08138 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NGFRP08138 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NGFRP08138 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NGFRP08138 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NGFRP08138 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NGFRP08138 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NGFRP08138 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NGFRP08138 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NGFRP08138 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NGFRP08138 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NGFRP08138 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms