Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CSF1RP07333 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CSF1RP07333 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms