Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLK3P07288 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLK3P07288 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLK3P07288 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KLK3P07288 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLK3P07288 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLK3P07288 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLK3P07288 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLK3P07288 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLK3P07288 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLK3P07288 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLK3P07288 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLK3P07288 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLK3P07288 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLK3P07288 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLK3P07288 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLK3P07288 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLK3P07288 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLK3P07288 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLK3P07288 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLK3P07288 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLK3P07288 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLK3P07288 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLK3P07288 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLK3P07288 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KLK3P07288 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLK3P07288 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
KLK3P07288 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLK3P07288 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLK3P07288 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLK3P07288 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLK3P07288 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLK3P07288 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLK3P07288 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLK3P07288 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLK3P07288 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLK3P07288 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLK3P07288 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLK3P07288 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLK3P07288 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KLK3P07288 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KLK3P07288 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLK3P07288 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLK3P07288 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLK3P07288 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLK3P07288 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KLK3P07288 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLK3P07288 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLK3P07288 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLK3P07288 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLK3P07288 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLK3P07288 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLK3P07288 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLK3P07288 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLK3P07288 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLK3P07288 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLK3P07288 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLK3P07288 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLK3P07288 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLK3P07288 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLK3P07288 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLK3P07288 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLK3P07288 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLK3P07288 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLK3P07288 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLK3P07288 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KLK3P07288 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLK3P07288 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KLK3P07288 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLK3P07288 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLK3P07288 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLK3P07288 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLK3P07288 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLK3P07288 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLK3P07288 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLK3P07288 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLK3P07288 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLK3P07288 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLK3P07288 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLK3P07288 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLK3P07288 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLK3P07288 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLK3P07288 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLK3P07288 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLK3P07288 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLK3P07288 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLK3P07288 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KLK3P07288 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLK3P07288 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLK3P07288 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLK3P07288 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLK3P07288 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLK3P07288 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLK3P07288 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLK3P07288 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLK3P07288 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLK3P07288 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLK3P07288 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLK3P07288 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLK3P07288 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms