Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLBP06746 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLBP06746 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLBP06746 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLBP06746 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLBP06746 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLBP06746 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLBP06746 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLBP06746 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLBP06746 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLBP06746 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLBP06746 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLBP06746 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLBP06746 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLBP06746 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLBP06746 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLBP06746 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLBP06746 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLBP06746 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLBP06746 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLBP06746 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLBP06746 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLBP06746 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLBP06746 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLBP06746 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLBP06746 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLBP06746 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLBP06746 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLBP06746 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLBP06746 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLBP06746 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLBP06746 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POLBP06746 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLBP06746 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLBP06746 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLBP06746 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLBP06746 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLBP06746 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLBP06746 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLBP06746 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLBP06746 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLBP06746 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLBP06746 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLBP06746 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLBP06746 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLBP06746 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLBP06746 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLBP06746 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLBP06746 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLBP06746 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLBP06746 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POLBP06746 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLBP06746 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLBP06746 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLBP06746 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLBP06746 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLBP06746 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLBP06746 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLBP06746 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLBP06746 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLBP06746 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLBP06746 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLBP06746 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLBP06746 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLBP06746 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLBP06746 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POLBP06746 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POLBP06746 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLBP06746 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLBP06746 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLBP06746 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLBP06746 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLBP06746 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLBP06746 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLBP06746 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
POLBP06746 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLBP06746 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLBP06746 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLBP06746 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLBP06746 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLBP06746 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLBP06746 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLBP06746 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLBP06746 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLBP06746 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLBP06746 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLBP06746 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLBP06746 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLBP06746 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLBP06746 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLBP06746 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLBP06746 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLBP06746 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLBP06746 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
POLBP06746 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLBP06746 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLBP06746 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLBP06746 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLBP06746 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLBP06746 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms