Protein–RNA interactions for Protein: P04920

SLC4A2, Anion exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A2P04920 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC4A2P04920 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC4A2P04920 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC4A2P04920 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC4A2P04920 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC4A2P04920 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC4A2P04920 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC4A2P04920 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC4A2P04920 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC4A2P04920 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC4A2P04920 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC4A2P04920 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC4A2P04920 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC4A2P04920 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC4A2P04920 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC4A2P04920 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC4A2P04920 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC4A2P04920 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms