Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYBBP04839 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYBBP04839 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYBBP04839 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYBBP04839 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYBBP04839 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYBBP04839 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYBBP04839 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYBBP04839 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYBBP04839 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYBBP04839 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYBBP04839 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYBBP04839 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYBBP04839 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYBBP04839 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CYBBP04839 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYBBP04839 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYBBP04839 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYBBP04839 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYBBP04839 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYBBP04839 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CYBBP04839 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYBBP04839 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYBBP04839 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYBBP04839 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYBBP04839 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYBBP04839 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYBBP04839 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYBBP04839 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYBBP04839 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYBBP04839 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYBBP04839 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYBBP04839 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYBBP04839 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYBBP04839 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYBBP04839 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYBBP04839 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYBBP04839 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYBBP04839 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYBBP04839 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYBBP04839 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYBBP04839 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYBBP04839 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYBBP04839 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYBBP04839 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYBBP04839 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYBBP04839 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYBBP04839 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYBBP04839 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYBBP04839 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYBBP04839 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYBBP04839 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYBBP04839 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYBBP04839 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYBBP04839 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYBBP04839 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYBBP04839 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYBBP04839 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYBBP04839 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYBBP04839 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYBBP04839 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYBBP04839 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYBBP04839 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYBBP04839 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYBBP04839 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYBBP04839 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYBBP04839 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYBBP04839 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYBBP04839 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYBBP04839 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYBBP04839 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CYBBP04839 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYBBP04839 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYBBP04839 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYBBP04839 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYBBP04839 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYBBP04839 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CYBBP04839 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CYBBP04839 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYBBP04839 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYBBP04839 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYBBP04839 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYBBP04839 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYBBP04839 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYBBP04839 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYBBP04839 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYBBP04839 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYBBP04839 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYBBP04839 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYBBP04839 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYBBP04839 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYBBP04839 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYBBP04839 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYBBP04839 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYBBP04839 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CYBBP04839 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYBBP04839 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CYBBP04839 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CYBBP04839 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYBBP04839 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms