Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
VTNP04004 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
VTNP04004 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VTNP04004 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VTNP04004 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VTNP04004 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VTNP04004 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VTNP04004 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VTNP04004 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VTNP04004 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VTNP04004 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VTNP04004 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VTNP04004 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VTNP04004 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VTNP04004 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VTNP04004 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VTNP04004 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VTNP04004 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VTNP04004 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VTNP04004 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VTNP04004 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VTNP04004 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VTNP04004 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VTNP04004 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VTNP04004 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VTNP04004 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VTNP04004 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VTNP04004 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VTNP04004 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VTNP04004 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VTNP04004 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
VTNP04004 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VTNP04004 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VTNP04004 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VTNP04004 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VTNP04004 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VTNP04004 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VTNP04004 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VTNP04004 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VTNP04004 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VTNP04004 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VTNP04004 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VTNP04004 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VTNP04004 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VTNP04004 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VTNP04004 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VTNP04004 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VTNP04004 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VTNP04004 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VTNP04004 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VTNP04004 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VTNP04004 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VTNP04004 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VTNP04004 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
VTNP04004 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VTNP04004 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VTNP04004 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VTNP04004 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VTNP04004 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VTNP04004 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VTNP04004 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VTNP04004 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VTNP04004 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VTNP04004 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VTNP04004 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VTNP04004 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VTNP04004 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VTNP04004 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VTNP04004 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VTNP04004 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VTNP04004 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VTNP04004 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VTNP04004 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
VTNP04004 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VTNP04004 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VTNP04004 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VTNP04004 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VTNP04004 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VTNP04004 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VTNP04004 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VTNP04004 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VTNP04004 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VTNP04004 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VTNP04004 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VTNP04004 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VTNP04004 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VTNP04004 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VTNP04004 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VTNP04004 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VTNP04004 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VTNP04004 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VTNP04004 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VTNP04004 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VTNP04004 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VTNP04004 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTNP04004 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTNP04004 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTNP04004 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTNP04004 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTNP04004 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms