Protein–RNA interactions for Protein: P03999

OPN1SW, Short-wave-sensitive opsin 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1SWP03999 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms