Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGKV1-17P01599 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
IGKV1-17P01599 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGKV1-17P01599 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGKV1-17P01599 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGKV1-17P01599 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms