Protein–RNA interactions for Protein: P01189

POMC, Pro-opiomelanocortin, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMCP01189 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POMCP01189 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POMCP01189 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POMCP01189 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POMCP01189 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POMCP01189 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POMCP01189 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POMCP01189 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POMCP01189 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POMCP01189 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POMCP01189 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POMCP01189 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
POMCP01189 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
POMCP01189 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
POMCP01189 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POMCP01189 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POMCP01189 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POMCP01189 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POMCP01189 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POMCP01189 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POMCP01189 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POMCP01189 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
POMCP01189 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POMCP01189 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POMCP01189 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POMCP01189 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POMCP01189 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POMCP01189 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POMCP01189 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POMCP01189 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POMCP01189 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POMCP01189 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
POMCP01189 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POMCP01189 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POMCP01189 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POMCP01189 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POMCP01189 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POMCP01189 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POMCP01189 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POMCP01189 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POMCP01189 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POMCP01189 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POMCP01189 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POMCP01189 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POMCP01189 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POMCP01189 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POMCP01189 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POMCP01189 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
POMCP01189 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POMCP01189 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POMCP01189 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POMCP01189 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POMCP01189 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POMCP01189 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POMCP01189 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POMCP01189 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POMCP01189 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POMCP01189 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POMCP01189 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POMCP01189 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POMCP01189 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POMCP01189 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POMCP01189 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POMCP01189 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POMCP01189 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POMCP01189 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POMCP01189 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POMCP01189 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POMCP01189 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POMCP01189 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POMCP01189 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POMCP01189 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POMCP01189 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POMCP01189 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POMCP01189 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POMCP01189 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
POMCP01189 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POMCP01189 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POMCP01189 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POMCP01189 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POMCP01189 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POMCP01189 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POMCP01189 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POMCP01189 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POMCP01189 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POMCP01189 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POMCP01189 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POMCP01189 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POMCP01189 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POMCP01189 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POMCP01189 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
POMCP01189 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
POMCP01189 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POMCP01189 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POMCP01189 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POMCP01189 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POMCP01189 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POMCP01189 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POMCP01189 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POMCP01189 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms