Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1RP00736 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1RP00736 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1RP00736 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1RP00736 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1RP00736 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1RP00736 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1RP00736 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1RP00736 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1RP00736 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1RP00736 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1RP00736 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1RP00736 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1RP00736 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1RP00736 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1RP00736 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1RP00736 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1RP00736 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1RP00736 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1RP00736 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
C1RP00736 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C1RP00736 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1RP00736 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1RP00736 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1RP00736 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1RP00736 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1RP00736 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1RP00736 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C1RP00736 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C1RP00736 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1RP00736 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1RP00736 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1RP00736 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1RP00736 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1RP00736 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1RP00736 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1RP00736 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C1RP00736 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C1RP00736 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C1RP00736 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1RP00736 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1RP00736 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1RP00736 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
C1RP00736 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1RP00736 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1RP00736 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1RP00736 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1RP00736 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
C1RP00736 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1RP00736 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
C1RP00736 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1RP00736 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1RP00736 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1RP00736 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1RP00736 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
C1RP00736 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1RP00736 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1RP00736 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1RP00736 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1RP00736 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1RP00736 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1RP00736 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1RP00736 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1RP00736 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
C1RP00736 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1RP00736 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1RP00736 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1RP00736 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1RP00736 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
C1RP00736 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1RP00736 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1RP00736 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1RP00736 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1RP00736 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1RP00736 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1RP00736 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
C1RP00736 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
C1RP00736 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1RP00736 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1RP00736 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1RP00736 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1RP00736 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1RP00736 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1RP00736 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1RP00736 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1RP00736 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1RP00736 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1RP00736 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1RP00736 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1RP00736 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1RP00736 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C1RP00736 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1RP00736 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1RP00736 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1RP00736 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1RP00736 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1RP00736 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1RP00736 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1RP00736 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C1RP00736 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms