Protein–RNA interactions for Protein: O96017

CHEK2, Serine/threonine-protein kinase Chk2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHEK2O96017 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHEK2O96017 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms