Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRD1O95696 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRD1O95696 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRD1O95696 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRD1O95696 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRD1O95696 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRD1O95696 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRD1O95696 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRD1O95696 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRD1O95696 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRD1O95696 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRD1O95696 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRD1O95696 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRD1O95696 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRD1O95696 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRD1O95696 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRD1O95696 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRD1O95696 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRD1O95696 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRD1O95696 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRD1O95696 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRD1O95696 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
BRD1O95696 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD1O95696 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD1O95696 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD1O95696 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD1O95696 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD1O95696 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD1O95696 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD1O95696 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD1O95696 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRD1O95696 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
BRD1O95696 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRD1O95696 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRD1O95696 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRD1O95696 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRD1O95696 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRD1O95696 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRD1O95696 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRD1O95696 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRD1O95696 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRD1O95696 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRD1O95696 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRD1O95696 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRD1O95696 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRD1O95696 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRD1O95696 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRD1O95696 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRD1O95696 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRD1O95696 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRD1O95696 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRD1O95696 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRD1O95696 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRD1O95696 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRD1O95696 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRD1O95696 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRD1O95696 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRD1O95696 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRD1O95696 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRD1O95696 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRD1O95696 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRD1O95696 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRD1O95696 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRD1O95696 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
BRD1O95696 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRD1O95696 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRD1O95696 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
BRD1O95696 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRD1O95696 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRD1O95696 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRD1O95696 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BRD1O95696 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRD1O95696 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BRD1O95696 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRD1O95696 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRD1O95696 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRD1O95696 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRD1O95696 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRD1O95696 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRD1O95696 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRD1O95696 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRD1O95696 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
BRD1O95696 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRD1O95696 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
BRD1O95696 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRD1O95696 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRD1O95696 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
BRD1O95696 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
BRD1O95696 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRD1O95696 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRD1O95696 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRD1O95696 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRD1O95696 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRD1O95696 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRD1O95696 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRD1O95696 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRD1O95696 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRD1O95696 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRD1O95696 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRD1O95696 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms