Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms