Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEC24AO95486 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.5 ms