Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG7O95352 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG7O95352 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG7O95352 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG7O95352 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG7O95352 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG7O95352 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG7O95352 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG7O95352 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG7O95352 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG7O95352 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG7O95352 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG7O95352 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG7O95352 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG7O95352 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG7O95352 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG7O95352 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG7O95352 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG7O95352 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG7O95352 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG7O95352 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG7O95352 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG7O95352 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG7O95352 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG7O95352 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG7O95352 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG7O95352 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG7O95352 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG7O95352 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG7O95352 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG7O95352 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG7O95352 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG7O95352 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG7O95352 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG7O95352 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG7O95352 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG7O95352 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG7O95352 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG7O95352 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG7O95352 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG7O95352 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG7O95352 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG7O95352 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG7O95352 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG7O95352 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG7O95352 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATG7O95352 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATG7O95352 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG7O95352 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG7O95352 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG7O95352 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG7O95352 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG7O95352 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG7O95352 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG7O95352 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG7O95352 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG7O95352 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG7O95352 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG7O95352 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG7O95352 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG7O95352 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG7O95352 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG7O95352 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG7O95352 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG7O95352 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG7O95352 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG7O95352 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG7O95352 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG7O95352 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG7O95352 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG7O95352 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG7O95352 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG7O95352 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG7O95352 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG7O95352 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG7O95352 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG7O95352 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG7O95352 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG7O95352 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG7O95352 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG7O95352 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG7O95352 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG7O95352 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG7O95352 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG7O95352 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG7O95352 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG7O95352 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG7O95352 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG7O95352 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG7O95352 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG7O95352 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG7O95352 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG7O95352 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG7O95352 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG7O95352 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG7O95352 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG7O95352 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG7O95352 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG7O95352 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG7O95352 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms