Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB3O75712 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB3O75712 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB3O75712 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB3O75712 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB3O75712 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB3O75712 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB3O75712 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB3O75712 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB3O75712 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB3O75712 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB3O75712 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB3O75712 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB3O75712 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB3O75712 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB3O75712 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB3O75712 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB3O75712 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB3O75712 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB3O75712 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB3O75712 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB3O75712 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB3O75712 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB3O75712 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB3O75712 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB3O75712 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB3O75712 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB3O75712 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB3O75712 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB3O75712 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB3O75712 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB3O75712 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB3O75712 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB3O75712 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB3O75712 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB3O75712 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB3O75712 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB3O75712 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB3O75712 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB3O75712 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB3O75712 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB3O75712 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB3O75712 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB3O75712 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB3O75712 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB3O75712 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB3O75712 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GJB3O75712 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB3O75712 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB3O75712 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB3O75712 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB3O75712 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB3O75712 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB3O75712 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB3O75712 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB3O75712 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB3O75712 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB3O75712 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB3O75712 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB3O75712 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB3O75712 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB3O75712 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB3O75712 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB3O75712 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB3O75712 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB3O75712 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB3O75712 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB3O75712 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB3O75712 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB3O75712 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB3O75712 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB3O75712 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB3O75712 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB3O75712 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB3O75712 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB3O75712 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB3O75712 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB3O75712 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB3O75712 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB3O75712 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB3O75712 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB3O75712 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB3O75712 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB3O75712 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB3O75712 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB3O75712 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB3O75712 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB3O75712 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB3O75712 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB3O75712 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB3O75712 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB3O75712 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB3O75712 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB3O75712 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB3O75712 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB3O75712 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB3O75712 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB3O75712 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB3O75712 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB3O75712 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms