Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMUO75648 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMUO75648 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMUO75648 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMUO75648 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMUO75648 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMUO75648 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMUO75648 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMUO75648 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMUO75648 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMUO75648 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMUO75648 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMUO75648 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMUO75648 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMUO75648 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMUO75648 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMUO75648 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMUO75648 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMUO75648 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMUO75648 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMUO75648 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMUO75648 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMUO75648 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMUO75648 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMUO75648 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMUO75648 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMUO75648 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMUO75648 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMUO75648 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMUO75648 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMUO75648 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMUO75648 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMUO75648 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMUO75648 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMUO75648 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRMUO75648 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRMUO75648 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRMUO75648 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRMUO75648 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRMUO75648 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMUO75648 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMUO75648 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMUO75648 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMUO75648 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMUO75648 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMUO75648 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMUO75648 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMUO75648 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMUO75648 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMUO75648 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMUO75648 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMUO75648 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMUO75648 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMUO75648 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMUO75648 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMUO75648 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMUO75648 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMUO75648 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMUO75648 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMUO75648 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMUO75648 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMUO75648 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMUO75648 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMUO75648 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMUO75648 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMUO75648 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMUO75648 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMUO75648 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMUO75648 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMUO75648 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMUO75648 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMUO75648 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMUO75648 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMUO75648 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMUO75648 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMUO75648 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMUO75648 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMUO75648 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMUO75648 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMUO75648 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMUO75648 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMUO75648 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMUO75648 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMUO75648 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMUO75648 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMUO75648 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMUO75648 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMUO75648 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMUO75648 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMUO75648 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMUO75648 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMUO75648 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMUO75648 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMUO75648 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMUO75648 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMUO75648 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMUO75648 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMUO75648 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMUO75648 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMUO75648 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms