Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPM3O75607 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPM3O75607 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPM3O75607 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NPM3O75607 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPM3O75607 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPM3O75607 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPM3O75607 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPM3O75607 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPM3O75607 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPM3O75607 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPM3O75607 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPM3O75607 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPM3O75607 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NPM3O75607 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPM3O75607 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NPM3O75607 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPM3O75607 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPM3O75607 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPM3O75607 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPM3O75607 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPM3O75607 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPM3O75607 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPM3O75607 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPM3O75607 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NPM3O75607 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NPM3O75607 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPM3O75607 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPM3O75607 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPM3O75607 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPM3O75607 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPM3O75607 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPM3O75607 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPM3O75607 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NPM3O75607 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPM3O75607 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NPM3O75607 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPM3O75607 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPM3O75607 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPM3O75607 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPM3O75607 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPM3O75607 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPM3O75607 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPM3O75607 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPM3O75607 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPM3O75607 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPM3O75607 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPM3O75607 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPM3O75607 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPM3O75607 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NPM3O75607 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPM3O75607 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPM3O75607 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPM3O75607 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPM3O75607 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPM3O75607 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPM3O75607 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPM3O75607 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPM3O75607 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NPM3O75607 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPM3O75607 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPM3O75607 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPM3O75607 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPM3O75607 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NPM3O75607 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NPM3O75607 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPM3O75607 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPM3O75607 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPM3O75607 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPM3O75607 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPM3O75607 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPM3O75607 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPM3O75607 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPM3O75607 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPM3O75607 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPM3O75607 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NPM3O75607 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NPM3O75607 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NPM3O75607 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NPM3O75607 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NPM3O75607 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NPM3O75607 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NPM3O75607 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NPM3O75607 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NPM3O75607 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NPM3O75607 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NPM3O75607 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NPM3O75607 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NPM3O75607 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
NPM3O75607 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPM3O75607 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPM3O75607 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NPM3O75607 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NPM3O75607 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPM3O75607 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPM3O75607 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPM3O75607 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NPM3O75607 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NPM3O75607 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NPM3O75607 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms