Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LRP5O75197 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
LRP5O75197 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
LRP5O75197 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRP5O75197 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRP5O75197 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRP5O75197 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRP5O75197 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRP5O75197 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRP5O75197 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
LRP5O75197 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRP5O75197 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRP5O75197 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRP5O75197 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
LRP5O75197 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
LRP5O75197 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRP5O75197 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRP5O75197 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRP5O75197 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRP5O75197 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRP5O75197 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRP5O75197 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRP5O75197 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRP5O75197 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRP5O75197 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRP5O75197 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRP5O75197 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRP5O75197 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRP5O75197 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRP5O75197 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRP5O75197 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRP5O75197 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRP5O75197 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRP5O75197 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRP5O75197 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRP5O75197 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
LRP5O75197 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRP5O75197 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRP5O75197 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRP5O75197 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRP5O75197 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRP5O75197 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRP5O75197 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRP5O75197 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRP5O75197 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRP5O75197 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRP5O75197 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
LRP5O75197 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRP5O75197 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRP5O75197 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRP5O75197 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRP5O75197 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRP5O75197 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRP5O75197 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRP5O75197 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRP5O75197 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRP5O75197 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRP5O75197 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRP5O75197 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRP5O75197 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRP5O75197 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRP5O75197 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
LRP5O75197 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
LRP5O75197 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRP5O75197 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRP5O75197 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRP5O75197 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRP5O75197 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRP5O75197 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRP5O75197 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRP5O75197 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRP5O75197 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRP5O75197 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRP5O75197 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
LRP5O75197 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRP5O75197 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRP5O75197 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRP5O75197 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
LRP5O75197 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRP5O75197 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
LRP5O75197 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRP5O75197 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRP5O75197 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRP5O75197 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRP5O75197 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRP5O75197 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRP5O75197 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRP5O75197 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRP5O75197 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRP5O75197 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRP5O75197 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRP5O75197 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRP5O75197 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRP5O75197 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRP5O75197 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRP5O75197 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRP5O75197 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
LRP5O75197 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRP5O75197 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRP5O75197 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms