Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAB11FIP3O75154 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAB11FIP3O75154 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAB11FIP3O75154 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAB11FIP3O75154 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAB11FIP3O75154 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAB11FIP3O75154 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RAB11FIP3O75154 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAB11FIP3O75154 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAB11FIP3O75154 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAB11FIP3O75154 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAB11FIP3O75154 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAB11FIP3O75154 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAB11FIP3O75154 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAB11FIP3O75154 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAB11FIP3O75154 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB11FIP3O75154 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB11FIP3O75154 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB11FIP3O75154 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB11FIP3O75154 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB11FIP3O75154 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB11FIP3O75154 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB11FIP3O75154 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAB11FIP3O75154 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAB11FIP3O75154 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAB11FIP3O75154 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAB11FIP3O75154 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAB11FIP3O75154 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAB11FIP3O75154 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAB11FIP3O75154 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAB11FIP3O75154 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms