Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF10O60809 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF10O60809 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms