Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ATP10AO60312 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ATP10AO60312 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms