Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
KIAA0556O60303 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
KIAA0556O60303 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
KIAA0556O60303 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
KIAA0556O60303 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
KIAA0556O60303 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
KIAA0556O60303 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
KIAA0556O60303 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
KIAA0556O60303 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
KIAA0556O60303 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
KIAA0556O60303 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
KIAA0556O60303 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
KIAA0556O60303 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
KIAA0556O60303 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
KIAA0556O60303 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
KIAA0556O60303 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
KIAA0556O60303 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
KIAA0556O60303 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
KIAA0556O60303 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
KIAA0556O60303 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
KIAA0556O60303 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
KIAA0556O60303 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
KIAA0556O60303 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
KIAA0556O60303 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
KIAA0556O60303 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.5
KIAA0556O60303 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
KIAA0556O60303 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
KIAA0556O60303 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
KIAA0556O60303 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
KIAA0556O60303 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
KIAA0556O60303 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
KIAA0556O60303 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
KIAA0556O60303 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
KIAA0556O60303 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
KIAA0556O60303 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
KIAA0556O60303 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
KIAA0556O60303 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
KIAA0556O60303 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
KIAA0556O60303 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
KIAA0556O60303 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
KIAA0556O60303 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
KIAA0556O60303 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
KIAA0556O60303 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
KIAA0556O60303 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
KIAA0556O60303 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
KIAA0556O60303 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
KIAA0556O60303 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
KIAA0556O60303 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
KIAA0556O60303 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
KIAA0556O60303 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
KIAA0556O60303 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
KIAA0556O60303 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
KIAA0556O60303 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
KIAA0556O60303 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
KIAA0556O60303 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
KIAA0556O60303 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
KIAA0556O60303 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
KIAA0556O60303 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC36.81■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC36.8■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC36.79■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
KIAA0556O60303 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms