Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
PLIN1O60240 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PLIN1O60240 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PLIN1O60240 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PLIN1O60240 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PLIN1O60240 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PLIN1O60240 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PLIN1O60240 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PLIN1O60240 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PLIN1O60240 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PLIN1O60240 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PLIN1O60240 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PLIN1O60240 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PLIN1O60240 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PLIN1O60240 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PLIN1O60240 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PLIN1O60240 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PLIN1O60240 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms