Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC28A2O43868 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms