Protein–RNA interactions for Protein: O43791

SPOP, Speckle-type POZ protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOPO43791 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPOPO43791 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPOPO43791 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPOPO43791 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPOPO43791 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPOPO43791 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPOPO43791 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPOPO43791 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPOPO43791 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPOPO43791 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPOPO43791 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPOPO43791 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPOPO43791 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPOPO43791 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPOPO43791 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPOPO43791 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPOPO43791 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SPOPO43791 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPOPO43791 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPOPO43791 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPOPO43791 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPOPO43791 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPOPO43791 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPOPO43791 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPOPO43791 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPOPO43791 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPOPO43791 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPOPO43791 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPOPO43791 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPOPO43791 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPOPO43791 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPOPO43791 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPOPO43791 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPOPO43791 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPOPO43791 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPOPO43791 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPOPO43791 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPOPO43791 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPOPO43791 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPOPO43791 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPOPO43791 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPOPO43791 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPOPO43791 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPOPO43791 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPOPO43791 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPOPO43791 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPOPO43791 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPOPO43791 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPOPO43791 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPOPO43791 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPOPO43791 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPOPO43791 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPOPO43791 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPOPO43791 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPOPO43791 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPOPO43791 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SPOPO43791 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPOPO43791 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPOPO43791 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPOPO43791 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPOPO43791 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPOPO43791 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPOPO43791 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPOPO43791 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPOPO43791 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPOPO43791 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPOPO43791 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPOPO43791 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPOPO43791 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPOPO43791 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPOPO43791 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SPOPO43791 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPOPO43791 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPOPO43791 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SPOPO43791 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPOPO43791 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPOPO43791 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPOPO43791 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPOPO43791 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPOPO43791 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPOPO43791 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPOPO43791 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPOPO43791 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPOPO43791 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPOPO43791 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPOPO43791 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPOPO43791 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPOPO43791 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPOPO43791 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPOPO43791 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPOPO43791 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPOPO43791 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPOPO43791 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPOPO43791 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPOPO43791 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPOPO43791 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPOPO43791 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPOPO43791 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPOPO43791 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPOPO43791 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms