Protein–RNA interactions for Protein: O43759

SYNGR1, Synaptogyrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR1O43759 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNGR1O43759 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNGR1O43759 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR1O43759 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR1O43759 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR1O43759 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR1O43759 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR1O43759 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR1O43759 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR1O43759 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR1O43759 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR1O43759 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR1O43759 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR1O43759 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR1O43759 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR1O43759 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR1O43759 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR1O43759 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR1O43759 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR1O43759 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR1O43759 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR1O43759 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR1O43759 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR1O43759 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR1O43759 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR1O43759 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR1O43759 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms