Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATCO43716 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATCO43716 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATCO43716 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATCO43716 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATCO43716 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATCO43716 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATCO43716 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATCO43716 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATCO43716 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATCO43716 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATCO43716 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATCO43716 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATCO43716 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATCO43716 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATCO43716 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GATCO43716 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GATCO43716 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GATCO43716 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GATCO43716 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GATCO43716 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GATCO43716 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GATCO43716 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GATCO43716 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GATCO43716 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GATCO43716 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GATCO43716 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GATCO43716 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GATCO43716 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GATCO43716 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GATCO43716 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GATCO43716 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GATCO43716 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GATCO43716 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GATCO43716 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GATCO43716 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GATCO43716 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GATCO43716 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GATCO43716 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GATCO43716 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GATCO43716 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATCO43716 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GATCO43716 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATCO43716 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATCO43716 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATCO43716 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATCO43716 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATCO43716 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATCO43716 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATCO43716 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATCO43716 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATCO43716 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATCO43716 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GATCO43716 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GATCO43716 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GATCO43716 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GATCO43716 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GATCO43716 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GATCO43716 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GATCO43716 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GATCO43716 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GATCO43716 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GATCO43716 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GATCO43716 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GATCO43716 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GATCO43716 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GATCO43716 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GATCO43716 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GATCO43716 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GATCO43716 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GATCO43716 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GATCO43716 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GATCO43716 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GATCO43716 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GATCO43716 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GATCO43716 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GATCO43716 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GATCO43716 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GATCO43716 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GATCO43716 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATCO43716 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATCO43716 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATCO43716 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GATCO43716 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATCO43716 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATCO43716 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATCO43716 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GATCO43716 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATCO43716 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATCO43716 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATCO43716 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATCO43716 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATCO43716 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATCO43716 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATCO43716 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GATCO43716 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GATCO43716 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GATCO43716 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GATCO43716 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GATCO43716 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms