Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MAP3K13O43283 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms