Protein–RNA interactions for Protein: O15269

SPTLC1, Serine palmitoyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC1O15269 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SPTLC1O15269 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPTLC1O15269 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPTLC1O15269 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPTLC1O15269 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPTLC1O15269 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPTLC1O15269 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTLC1O15269 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTLC1O15269 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTLC1O15269 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTLC1O15269 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTLC1O15269 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTLC1O15269 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTLC1O15269 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPTLC1O15269 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPTLC1O15269 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPTLC1O15269 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPTLC1O15269 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SPTLC1O15269 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms