Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASKO14936 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CASKO14936 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASKO14936 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASKO14936 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASKO14936 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASKO14936 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASKO14936 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASKO14936 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASKO14936 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASKO14936 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASKO14936 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASKO14936 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASKO14936 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASKO14936 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASKO14936 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASKO14936 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASKO14936 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASKO14936 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASKO14936 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASKO14936 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASKO14936 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASKO14936 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASKO14936 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASKO14936 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASKO14936 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASKO14936 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASKO14936 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASKO14936 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CASKO14936 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASKO14936 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CASKO14936 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASKO14936 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASKO14936 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASKO14936 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASKO14936 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASKO14936 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASKO14936 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASKO14936 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASKO14936 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASKO14936 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASKO14936 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASKO14936 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASKO14936 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASKO14936 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CASKO14936 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CASKO14936 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASKO14936 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASKO14936 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASKO14936 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASKO14936 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASKO14936 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASKO14936 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASKO14936 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASKO14936 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASKO14936 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASKO14936 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASKO14936 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASKO14936 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASKO14936 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASKO14936 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASKO14936 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASKO14936 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASKO14936 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASKO14936 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASKO14936 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASKO14936 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASKO14936 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASKO14936 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASKO14936 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASKO14936 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASKO14936 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASKO14936 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASKO14936 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CASKO14936 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CASKO14936 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASKO14936 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CASKO14936 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASKO14936 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASKO14936 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASKO14936 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASKO14936 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASKO14936 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASKO14936 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASKO14936 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASKO14936 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASKO14936 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASKO14936 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASKO14936 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASKO14936 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASKO14936 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASKO14936 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASKO14936 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASKO14936 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASKO14936 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASKO14936 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CASKO14936 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CASKO14936 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CASKO14936 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CASKO14936 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms