Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MEIS1O00470 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MEIS1O00470 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MEIS1O00470 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MEIS1O00470 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MEIS1O00470 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MEIS1O00470 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MEIS1O00470 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MEIS1O00470 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MEIS1O00470 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MEIS1O00470 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MEIS1O00470 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MEIS1O00470 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MEIS1O00470 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MEIS1O00470 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MEIS1O00470 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MEIS1O00470 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MEIS1O00470 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms