Protein–RNA interactions for Protein: H3BQF6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQF6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BQF6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BQF6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BQF6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BQF6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BQF6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BQF6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BQF6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BQF6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BQF6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BQF6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BQF6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BQF6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BQF6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BQF6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BQF6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BQF6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BQF6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BQF6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BQF6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BQF6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BQF6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BQF6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BQF6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BQF6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BQF6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BQF6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BQF6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BQF6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BQF6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BQF6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BQF6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BQF6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BQF6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BQF6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BQF6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BQF6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BQF6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BQF6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BQF6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BQF6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BQF6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BQF6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BQF6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BQF6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BQF6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BQF6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BQF6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BQF6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BQF6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BQF6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BQF6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BQF6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BQF6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BQF6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BQF6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
H3BQF6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BQF6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BQF6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BQF6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BQF6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQF6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQF6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQF6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQF6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQF6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQF6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQF6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQF6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQF6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQF6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQF6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQF6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQF6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQF6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3BQF6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3BQF6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3BQF6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3BQF6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3BQF6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BQF6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BQF6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BQF6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BQF6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BQF6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BQF6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BQF6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BQF6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BQF6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BQF6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BQF6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BQF6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BQF6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BQF6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BQF6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BQF6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BQF6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BQF6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BQF6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BQF6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms