Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GOLGA8SH3BPF8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms