Protein–RNA interactions for Protein: F8VRH5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VRH5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F8VRH5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F8VRH5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F8VRH5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F8VRH5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
F8VRH5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
F8VRH5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
F8VRH5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
F8VRH5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
F8VRH5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
F8VRH5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
F8VRH5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
F8VRH5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
F8VRH5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
F8VRH5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
F8VRH5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
F8VRH5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
F8VRH5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
F8VRH5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
F8VRH5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
F8VRH5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
F8VRH5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
F8VRH5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
F8VRH5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F8VRH5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F8VRH5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F8VRH5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F8VRH5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F8VRH5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F8VRH5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
F8VRH5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F8VRH5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F8VRH5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F8VRH5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
F8VRH5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F8VRH5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F8VRH5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F8VRH5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
F8VRH5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
F8VRH5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F8VRH5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
F8VRH5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
F8VRH5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
F8VRH5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F8VRH5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
F8VRH5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
F8VRH5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
F8VRH5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
F8VRH5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
F8VRH5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
F8VRH5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
F8VRH5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
F8VRH5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
F8VRH5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
F8VRH5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
F8VRH5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
F8VRH5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
F8VRH5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
F8VRH5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
F8VRH5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
F8VRH5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
F8VRH5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
F8VRH5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
F8VRH5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
F8VRH5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
F8VRH5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
F8VRH5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
F8VRH5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
F8VRH5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
F8VRH5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
F8VRH5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
F8VRH5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F8VRH5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
F8VRH5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F8VRH5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F8VRH5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F8VRH5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F8VRH5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F8VRH5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F8VRH5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
F8VRH5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
F8VRH5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F8VRH5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F8VRH5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F8VRH5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F8VRH5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F8VRH5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F8VRH5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F8VRH5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
F8VRH5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F8VRH5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F8VRH5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F8VRH5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F8VRH5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F8VRH5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F8VRH5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F8VRH5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F8VRH5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F8VRH5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F8VRH5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms