Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PBE3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PBE3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PBE3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PBE3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E9PBE3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E9PBE3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E9PBE3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E9PBE3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E9PBE3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E9PBE3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E9PBE3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E9PBE3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E9PBE3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E9PBE3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E9PBE3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E9PBE3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E9PBE3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E9PBE3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E9PBE3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
E9PBE3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E9PBE3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E9PBE3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E9PBE3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PBE3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PBE3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PBE3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PBE3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PBE3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PBE3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PBE3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PBE3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PBE3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PBE3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PBE3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PBE3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E9PBE3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E9PBE3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E9PBE3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E9PBE3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E9PBE3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E9PBE3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PBE3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PBE3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PBE3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PBE3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PBE3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PBE3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PBE3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PBE3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PBE3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PBE3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PBE3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E9PBE3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E9PBE3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E9PBE3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E9PBE3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E9PBE3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E9PBE3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E9PBE3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E9PBE3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E9PBE3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E9PBE3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E9PBE3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E9PBE3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E9PBE3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E9PBE3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
E9PBE3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E9PBE3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E9PBE3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E9PBE3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E9PBE3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E9PBE3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E9PBE3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E9PBE3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E9PBE3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E9PBE3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
E9PBE3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
E9PBE3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
E9PBE3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PBE3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PBE3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PBE3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PBE3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PBE3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PBE3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PBE3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PBE3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PBE3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PBE3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PBE3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PBE3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PBE3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E9PBE3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E9PBE3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E9PBE3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E9PBE3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E9PBE3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E9PBE3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E9PBE3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms