Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms