Protein–RNA interactions for Protein: A8MU46

SMTNL1, Smoothelin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNL1A8MU46 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMTNL1A8MU46 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMTNL1A8MU46 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms