Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NOTOA8MTQ0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms