Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NEURL1BA8MQ27 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEURL1BA8MQ27 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEURL1BA8MQ27 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEURL1BA8MQ27 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEURL1BA8MQ27 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEURL1BA8MQ27 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEURL1BA8MQ27 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NEURL1BA8MQ27 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms