Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SOBPA7XYQ1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
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