Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC169A6NNP5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms