Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDR42E2A6NKP2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms