Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms