Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP5A6NIR3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP5A6NIR3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP5A6NIR3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP5A6NIR3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AGAP5A6NIR3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AGAP5A6NIR3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AGAP5A6NIR3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP5A6NIR3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms