Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC69A6NI79 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms