Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYNDIG1LA6NDD5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms