Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN8

Uncharacterized protein ENSP00000372125, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NCN8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NCN8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NCN8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NCN8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NCN8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NCN8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NCN8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NCN8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NCN8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NCN8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NCN8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NCN8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NCN8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NCN8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NCN8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NCN8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NCN8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NCN8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NCN8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NCN8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NCN8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NCN8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NCN8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NCN8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NCN8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NCN8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NCN8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NCN8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NCN8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NCN8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NCN8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NCN8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NCN8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NCN8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NCN8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NCN8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NCN8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NCN8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NCN8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NCN8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NCN8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NCN8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NCN8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NCN8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NCN8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NCN8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NCN8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NCN8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NCN8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NCN8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NCN8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NCN8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NCN8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A6NCN8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A6NCN8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A6NCN8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A6NCN8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NCN8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NCN8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NCN8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NCN8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NCN8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NCN8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NCN8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NCN8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NCN8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NCN8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NCN8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NCN8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NCN8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NCN8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NCN8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NCN8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NCN8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NCN8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NCN8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NCN8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NCN8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NCN8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NCN8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NCN8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NCN8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NCN8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NCN8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NCN8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NCN8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NCN8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NCN8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NCN8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NCN8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NCN8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NCN8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NCN8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NCN8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NCN8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NCN8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NCN8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NCN8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NCN8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NCN8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms