Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRBA1A5PL33 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRBA1A5PL33 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRBA1A5PL33 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRBA1A5PL33 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KRBA1A5PL33 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRBA1A5PL33 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KRBA1A5PL33 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KRBA1A5PL33 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRBA1A5PL33 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRBA1A5PL33 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRBA1A5PL33 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRBA1A5PL33 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRBA1A5PL33 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRBA1A5PL33 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRBA1A5PL33 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRBA1A5PL33 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRBA1A5PL33 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRBA1A5PL33 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRBA1A5PL33 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRBA1A5PL33 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRBA1A5PL33 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRBA1A5PL33 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRBA1A5PL33 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRBA1A5PL33 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRBA1A5PL33 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRBA1A5PL33 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRBA1A5PL33 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRBA1A5PL33 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRBA1A5PL33 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRBA1A5PL33 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRBA1A5PL33 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRBA1A5PL33 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRBA1A5PL33 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRBA1A5PL33 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRBA1A5PL33 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms